Une équipe de direction est responsable de l'élaboration et du contenu des différents thèmes du réseau. L'équipe de direction se compose de participants aux groupes de travail et de comités qui apportent leur soutien et leurs conseils sur des questions spécifiques. Ces participants aux groupes de travail conseillent et coopèrent sur les questions relatives aux eaux souterraines et apportent à CH-GNet leur expertise et un point de vue issu de disciplines associées, telles que l'hydrologie, les sciences du sol, la chimie environnementale, l'écologie, l'ingénierie et les sciences sociales. L'équipe de direction définit la procédure en se basant sur l'orientation stratégique. La composition de l'équipe de direction dépend de l'orientation technique de chaque domaine thématique.